S’appuyant sur cet évident intérêt du public à l’égard des insectes, Jean Puech et Jacques Perrin imaginèrent un lieu qui rassemblerait des insectes vivants, les images non exploitées et le robot ayant servi aux prises de vues.
Un Syndicat Mixte « Centre Jean-Henri Fabre » fut pour cela constitué en 1995, composé de représentants du Conseil Général de l’Aveyron et du SIVOM (syndicat intercommunal à vocation multiple) des Monts et Lacs du Lévézou. C’est lui qui est maître d’ouvrage de l’opération. La réflexion sur le projet sera menée avec l’Association des amis de Jean-Henri Fabre.
Les travaux ont débuté en octobre 1998 à Saint-Léons, village d’origine de Jean-Henri Fabre, au cœur du parc naturel régional des Grands Causses.
Depuis le 1er octobre 1999, c’est la SA d’Economie Mixte Locale « Cité des insectes » qui a pris en charge la gestion, le développement et la commercialisation de Micropolis grâce à une convention d’affermage passé avec le Syndicat Mixte « Centre Jean-Henri Fabre ». La SAEML « Cité des insectes » est présidée par Pierre Raynal, vice-président du Conseil Général de l’Aveyron.
L’ouverture de Micropolis a eu lieu en juin 2000.